Flamurtari u themelua në vitin 1992, për herë të parë në gara kampionale në ligën komunale mori pjesë në sezonin garues 1993/94. Ishte nevojë e kohës që edhe ky vendbanim të themeloj një subjekt sportive në të cilën rinia do të mund të dëshmonin talentin e tyre, të largohen rrugës dhe në mënyrë të organizuar nëpërmjet sportit të prezantojnë kulturën e tyre .
